این واحد شامل آزمایشگاه های آنالیز دستگاهی( HPLC و GC ) شیمی فیزیک، میکروبیولوژی و کنترل حین تولید می باشد. آزمایشگاه های کنترل کیفیت متشکل از پرسنلی آموزش دیده می باشد که در راستای کنترل و حفظ شاخص های کیفی محصولات عهده دار وظایف زیر می باشند:

1. کنترل کیفیت مواد اولیه و ملزومات بسته بندی
2. کنترل کیفیت حین فرایند تولید
3. کنترل کیفیت و صحه گذاری محصولات تولیدی
4. انجام آزمونهای مرتبط با مواد اولیه و محصولات در فرایند تحقق محصولات جدید
5. کنترل عملکرد آبسازها و کنترل کیفیت (شیمیایی و میکروبی) آبهای تولید شده برای فرآیند تولید و نیروگاه
6. کنترل میکروبی اتاق های تمیز
7. ساخت و فرآوری “Working Standards” مورد نیاز مشتریان
8. تحقیقات مرتبط با روش های آنالیز